Amikor Lara Blackwood, a zseniális génsebész hívást kap, hogy segítsen kideríteni a Tokióban kitört félelmetes járvány okait, örömmel megtesz mindent, amit csak tud. Legnagyobb rémületére rá kell jönnie, hogy élete munkáját egy forradalmian új genetikai fegyver előállítására használták fel, ami az áldozatok ellen fordítja saját génjeik etnikai jellegzetességeit. Az emberiség ideje egyre fogy, miközben Lara megpróbálja feltárni a Slatewiper mögött álló döbbenetes összeesküvés nyomait, még mielőtt a rémálomba illő terv az egész emberi fajt a pusztulásba taszítaná.